吉林师范大学拥有1个教育部重点实验室(省部共建)、1个省科技创新中心、1个省高校重点实验室、1个省级工程研究中心、1个省高校工程研究中心、2个吉林特色文化研究基地、2个省高校人文社会科学重点研究基地等省级以上科研创新平台，拥有24个研究所。在新型功能材料、精细化工、生物工程、高效农业等产业发展领域，东北区域文化、社会主义核心价值体系构建等文化建设领域，为基础教育服务的教师教育领域都形成了明显的研究优势。新型半导体材料、医药中间体等研究国内先进，满族文化、东北边疆史等研究国内领先，教师教育研究独树一帜。